Παρασκευή, 7 Απριλίου 2017

Ανακαλύφθηκε μια νέα ομάδα γιγάντιων ιών. Novel group of giant viruses discovered

Giant virus acquiring genes from different eukaryotic host cells. This image complements the DOE Joint Genome Institute news release about the discovery of a novel group of giant viruses reported in the April 7, 2017 issue of Science. Credit: Ella Maru studio

Επιστήμονες στις ΗΠΑ και την Αυστρία, μεταξύ των οποίων ένας Έλληνας μικροβιολόγος, ανακάλυψαν μια νέα ομάδα γιγάντιων ιών, που ονόμασαν «Klosneuviruses».

Ο πρώτος γιγάντιος ιός, ο Mimivirus, είχε ανακαλυφθεί το 2003 από Γάλλους μικροβιολόγους, με επικεφαλής τον μικροβιολόγο του Πανεπιστημίου Αιξ-Μασσαλίας. Έκτοτε, αυτοί οι μικροοργανισμοί, που είναι κατά πολύ μεγαλύτεροι από τους συνηθισμένους ιούς, ασκούν μεγάλη γοητεία στους επιστήμονες, οι οποίοι στο μεταξύ έχουν ανακαλύψει μερικές ακόμα ομάδες τέτοιων μεγάλων ιών (Mamavirus, Megavirus και Pithovirus).

Giant viruses grow by acquiring DNA from other organisms, as shown in this GIF. Credit: Carla Schaffer / AAAS

Όπως δείχνει και η μελέτη του νέου ιού, οι γιγάντιοι ιοί φαίνεται να έχουν εξελιχθεί από τους μικρότερους ιούς, αποκτώντας (ή μάλλον κλέβοντας) στην εξελικτική πορεία τους εκατοντάδες γονίδια από άλλα κύτταρα, ενώ οι συνήθεις μικροί ιοί έχουν ελάχιστα γονίδια (π.χ. ο HIV του AIDS έχει μόνο εννέα, αλλά ο Mimivirus 1.018, ενώ ο Klosneuvirus περίπου 700).

Οι κάθε είδους και μεγέθους ιοί είναι πανταχού παρόντες στη Γη και ο πληθυσμός τους υπολογίζεται ότι φθάνει στον αστρονομικό αριθμό των 1031 (ο αριθμός 1 ακολουθούμενος από 31 μηδενικά), δεκαπλάσιος από τον εκτιμώμενο αριθμό των μικροβίων που υπολογίζονται σε 1030. Οι ιοί στον πλανήτη μας είναι περισσότεροι και από τα άστρα στο γαλαξία μας.

Οι ερευνητές του Κοινού Ινστιτούτου Γονιδιώματος του Υπουργείου Ενέργειας των ΗΠΑ, με επικεφαλής την Τάνια Βόϊκε και τον Νίκο Κυρπίδη, που έκαναν τη σχετική δημοσίευση στο περιοδικό «Science», εκτιμούν ότι ο Klosneuvirus ζει μέσα στα πρώτιστα (μονοκύτταρους ευκαρυωτικούς μικροοργανισμούς με πυρήνα), ασκώντας μεγάλη επίδραση πάνω τους.

Bubbling nitrifying activated sludge tank in Klosterneuburg, Austria, which was the source of the sludge samples used for microcolony sorting. This image complements the DOE Joint Genome Institute news release about the discovery of a novel group of giant viruses reported in the April 7, 2017 issue of Science. Credit: Marton Palatinszky

Η νέα ομάδα γιγάντιων ιών, που ανακαλύφθηκε κατά την ανάλυση δειγμάτων από ένα εργοστάσιο βιολογικού καθαρισμού λυμάτων στην πόλη Κλοστερνόϊμπουργκ της ανατολικής Αυστρίας, μοιάζει με τους μονοκύτταρους οργανισμούς περισσότερο από κάθε άλλο ιό.

Nikos C. Kyrpides, Ph.D. Prokaryote Super Program Head. Dr. Kyrpides joined the DOE Joint Genome Institute in 2004 to lead the Genome Biology Program and the development of the data management and comparative analysis platforms for microbial genomes and metagenomes (IMG). He became the Metagenomics Program head in 2010 and leads the Prokaryotic Super Program and the Microbiome Data Science Group since 2011. Prior to joining the DOE Joint Genome Institute, Dr. Kyrpides led the development of the genome analysis and Bioinformatics core at Integrated Genomics Inc. in Chicago, IL. He did his postdoctoral studies with Carl Woese at the University of Illinois at Urbana-Champaign and with Ross Overbeek at the Argonne National Laboratory.

Ο Νίκος Κυρπίδης σπούδασε βιολογία στο Αριστοτέλειο Πανεπιστήμιο Θεσσαλονίκης, πήρε το διδακτορικό του στη μοριακή βιολογία και βιοτεχνολογία από το Πανεπιστήμιο Κρήτης και έκανε μεταδιδακτορική έρευνα με τον διάσημο μικροβιολόγο Carl Woese στο Πανεπιστήμιο του Ιλινόις. Από το 2004 εργάζεται στο Joint Genome Institute του Υπουργείου Ενέργειας των ΗΠΑ, όπου διευθύνει σημαντικά ερευνητικά προγράμματα πάνω στην ανάλυση των γονιδιωμάτων των μικροοργανισμών.

Πηγές: "Giant viruses with an expanded complement of translation system components," Science (2017). science.sciencemag.org/cgi/doi/10.1126/science.aal4657 - http://www.amna.gr